交通运输部东海航海保障中心于2012年10月15日正式成立，新成立的东海航海保障中心整合了原上海海事局所属航标、测绘及通信等机构，属交通运输部直属事业单位，副局级建制，中心设9个内设机构（办公室、党群工作部、纪委办公室、人事教育处、计划装备处、财务审计处、航标导航处（值班室）、海事测绘处、通信信息处）和14个直属机构（其中航标处6个，分别位于连云港、上海、宁波、温州、福州、厦门；通信中心6个，分别位于连云港、上海、杭州、宁波、福州和厦门；海事测绘中心和海图中心各1个，均位于上海），均为正处级建制。

       东海航海保障中心主要承担辖区（北起江苏连云港南至福建东山的南黄海和东海海域包括浏河口以下长江口水域）海事航标建设养护、港口航道测量绘图、水上安全通信、海上应急清污，以及南京以下的长江水域水上安全通信等技术支持和服务保障职责。航标建设维护、港口航道测绘及水上安全通信是航运安全、水运经济发展及海洋开发利用的基础性、技术性、保障性工作。新中国成立以来，在国务院和交通运输部的高度重视、海事系统的全力推进下，东海海区航海保障工作与海区港口、航运经济发展齐头并进，共谱华章，各项工作不断取得新进展，实现新突破，为保障航行安全、服务经济发展、促进社会和谐稳定做出了重要的贡献。